Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2Q9UMS6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2Q9UMS6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms