Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC7AQ9ULT0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC7AQ9ULT0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC7AQ9ULT0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC7AQ9ULT0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TTC7AQ9ULT0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TTC7AQ9ULT0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TTC7AQ9ULT0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC7AQ9ULT0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC7AQ9ULT0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms