Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRIP2Q9ULQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRIP2Q9ULQ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms