Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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