Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF490Q9ULM2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms