Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIMKLBQ9ULI2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms