Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH9Q9ULB4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms