Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11EQ9UL52 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms