Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms