Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSEQ9UL01 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSEQ9UL01 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms