Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms