Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD2Q9UKL4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD2Q9UKL4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms