Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP11Q9UKA4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP11Q9UKA4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms