Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHORDC1Q9UHD1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms