Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRRDQ9UH36 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms