Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF20Q9UGU0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms