Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP4Q9UGJ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms