Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms