Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms