Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CWC15Q9P013 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC15Q9P013 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms