Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L2Q9NZM6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L2Q9NZM6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKD2L2Q9NZM6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms