Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSD3Q9NYI0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSD3Q9NYI0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms