Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALKBH4Q9NXW9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALKBH4Q9NXW9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms