Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM9Q9NXL9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM9Q9NXL9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM9Q9NXL9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms