Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM260Q9NX78 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms