Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJC28Q9NX36 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms