Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms