Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFT57Q9NWB7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT57Q9NWB7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms