Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM28Q9NW13 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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