Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3EQ9NVU0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms