Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A7Q9NVC3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms