Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF13Q9NV06 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms