Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDP1Q9NUW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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