Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBNL3Q9NUK0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms