Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GINM1Q9NU53 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GINM1Q9NU53 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GINM1Q9NU53 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms