Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB4Q9NTQ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB4Q9NTQ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms