Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PDS5BQ9NTI5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PDS5BQ9NTI5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
PDS5BQ9NTI5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms