Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PKDREJQ9NTG1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKDREJQ9NTG1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKDREJQ9NTG1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms