Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CISHQ9NSE2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CISHQ9NSE2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms