Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOMER3Q9NSC5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms