Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3GQ9NS98 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3GQ9NS98 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms