Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GKN1Q9NS71 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms