Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC31BQ9NQW1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms