Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN3Q9NQT6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms