Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPRD1BQ9NQG5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms