Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN4Q9NQC3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms