Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNB1IP1Q9NPC3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms