Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MID1IP1Q9NPA3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MID1IP1Q9NPA3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms