Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms