Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCB6Q9NP58 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms